Интеркаляционная модель биологического действия ароматических биологически активных соединений
Различают три основных типа нековалентного связывания БАС с ДНК [133, 140]: внешнее электростатическое связывание (рис. 1.2а), внешнее связывание с малой или большой канавкой двойной спирали ДНК (рис.
1.26) и интеркаляционное связывание (рис 1.2в). а) 6) в) Рисунок 1.2. Модели комплексообразования ароматических молекул с дуплексной формой ДНК [114]. а) - внешнее электростатическое связывание, 6) - внешнее связывание с канавкой, в) - интеркаляция между парами оснований |
Для большинства ароматических БАС доминирующим типом комплексообразования с ДНК является интеркаляция [55, 133, 211]. В соответствии с интеркаляционной моделью, впервые предложенной Лерманом [165], плоские полициклические хромофоры ароматических молекул размещаются между соседними парами оснований двойной спирали ДНК (рис. 1.2в). Плоскость интеркалированной молекулы параллельна плоскости пар оснований ДНК и практически перпендикулярна оси спирали. В формировании данного комплекса основную роль играют электростатические, Ван-дер-
Ваальсовы и гидрофобные взаимодействия, совместно с возможными водородными связями между лигандом и ДНК [55, 133, 165].
1.3.1.